締め切り

概要

Option A

1. 定常状態の式(スライドのp.13)が成立することを簡単に証明せよ。
2. GAのシミュレーションを行って平衡状態の分布図(スライドのp.14)を実験的にプロットせよ。
3. 新しい遺伝子（突然変異）のランナウェイの侵入が生じることをいくつかのパラメータで実験してみよ（スライドのp.19）。

• Sexual Selection and the Evolution of Female Choice

• Kirkpatrickが提案したモデルによる性選択のシミュレーション
• Kirkpatrickが提案したモデルを二次元格子モデルに拡張した性選択のシミュレーション

Option B

1. 尾の長さだけに適応するニューラルネットワークの学習をする。 学習例には長いもの、短いものなどを与える。
2. 学習されたニューラルネットワークに対して学習例を進化させる。 長いほど適合度を低くする。
3. 学習が終わったら、ランダムに生成した学習例に対して認識率と適合度を評価する。すると適合度が低いにもかかわらず、長い尾が進化していた。

• Female preference for symmetrical males as a by-product of selection for mate recognition
• Symmetry, beauty and evolution

Option C

• von Neumannの自己増殖オートマトンの再現
  • Animplementation of von Neumann's self-reproducing machine. Artificial Life 2(4):337-354.
• 人流シミュレーション
  • Self-Organization Phenomena in Pedestrian CrowdsのFigs.1,2 and 3 のようなシミュレーションを行う。 廊下を反対方向に動く歩行者は、明確な指示がなくても自ら動きを調整して対向する流れを形成する。
  • 「流れ」の5章
• サンゴの成長モデル
  • Macroscopic Modelling of Environmental Influence on Growth and Form of Sponges and Corals Using the Accretive Growth Model
  • Verification of fractal growth models of the sponge Haliclona oculata (Porifera) with transplantation experiments
• ミツバチ・コロニーの巣板パターン
  • Self-Organization in Biological Systems (Princeton Studies in Complexity)
  • 生物にとって自己組織化とは何か: 群れ形成のメカニズムの16章（323ページから）に巣のセルラ・オートマトンによる形成モデルの説明がある。
  • 「かたち」の2章「ハチの巣の教訓：泡で築く」
• 生物の形態のパターン形成
  • 近藤滋先生のホームページを参照するとよい
  • 「かたち」の4章にチューリング・モデルの2次元版の解説がある

注意事項

• シミュレーションに関するドキュメント
  • １ページ目に必ず、名前、学籍番号、所属、学年 を記入すること。
  • 実現したシミュレーションに関する説明（どの部分をどう創意工夫したかなど）。
  • 実装法に関しての説明（ファイルのどの部分をどう変更したか？　など）。
  • ソースリストの簡単な説明（ソースコードにコメント付加するのでも良い）。
  • 実験結果に関する簡単な考察（複雑系シミュレーションとしての意義など）。
  • 授業に関するコメント、要望など（次回の参考にするので是非書いて下さい）。
• source code (こちらで実験を確認するので重要)

• 可視化をともなう複雑系のシミュレーションであること(とくにOption Cのとき)
• できるだけ一般的なシミュレーションツール、もしくは実行環境であること
• こちらで確認ができるようにreportにおいて実行環境について十分丁寧に説明すること

提出方法

• プログラムを作成した場合、 実現したシステムに関する説明（どの部分をどう創意工夫したかなど）。さら にアルゴリズム、ソースリストの説明。
• 結果の表示（グラフなどを用いると分かりやすい）。
• 結果に関する考察と評価。
• 授業に関するコメント、要望など（次回の参考にするので是非書いて下さい）。